Ecosystème intestinal et Santé optimale

Georges MOUTON - Médecin belge, consultation Madrid, Londres

Partie I : Microflore et muqueuse :

Chap 1 : à la découverte de la microflore

Plus de bactéries intestinales que de cellules : 1014 bactéries face à 1013 cellules.

Environ 2 kilos, moitié de la masse fécale.

50 espèces différentes regroupés en 90 genres.

Les gènes de ce microbiote codent pour 400000 gènes contre 35000 chez nous

Des bactéries mais aussi de petites quantités de levures

Chap 2 : Multiples rôles physiologiques :

Protège des bactéries pathogènes

- car elles occupent la place, présentent en grand nombre, elles monopolisent toute la nourriture.

La plupart des bactéries pathogènes ont besoin de se fixer aux entérocytes. Ex en cas de diarrhée, les toxines injectées dans les entérocytes entrainent une production de liquide (diarrhée)

- Secrètent des molécules bactéricides : β-défensine dans la bouche, et α-défensine par les cellules de Paneth en réponse aux bactéries.

- peut participer à la digestion : ex secretion d’enzymes : de lactase. (Attention, la lactase est secrétée au niveau de la bordure en brosse, en cas de diarrhée, perturbation de la muqueuse, donc éviter le lait pendant qq jours)

- synthèse de vitamines. Mais elles ne sont pas forcements absorbés car les nutriments sont absorbés au niveau du grêle et les bactéries sont plus vers le colon. Il semblerait que la moitié de la vit K proviennent de nos bactéries. Si des bactéries se retrouvent au niveau du grêle (dans les SIBO), on observe des forts taux sanguin de certaines vitamines, car les vitamines synthétisées se retrouvent alors absorbées.

B12 genre Pseudomonas et Klebsilla ou B9 dans la gastrique atrophique.

- Métabolisation des hormones stéroïdes. Fournie ainsi des noyaux stérols à partir de la dégradation des phytooestrogenes (génistéine -> génistine et de la daidzéine en daidzine). Il se peut qu’un déficit en DHEA sulfate provienne d’une carence en noyaux stérols

- Métabolisation des xénobiotiques. Protéines proches du cytochrome P450 contenu dans Eubacterium aerofaciens

- Modulent le tissu lymphoide de l’intestin Gut associated lymphoid tissue GALT

Ex : Stimulation des macrophages. Augmente production de cytokines par les macrophages (Lactobacillus rhamnosus et streptococcus pyogènes)

- Angiogenèse intestinale par les cellules de Paneth (suite à la stimulation de Bactérioses thetaiotaomicron)

Microflore évolue en fonction de l’âge

De manière générale : augmentation de flore de putréfaction (bacteroides, clostridium) et diminution de la flore de fermentation (Bifidobacterium et de Ruminococcus )

Chap 3 : Putréfaction et fermentation :

- Flore fermentation : Flore saccharolytique , Dysbiose : prolifération anormale : colon droit sensible, en particulier caecum.

Valve iléo-caecale un lieu d’élection des levures. Dysbiose de fermentation est aussi associée à une augmentation des levures

- Flore de putréfaction : Flore protéolytique. colon gauche, voire sigmoïde, produit des composés azotés typiques : ammoniaque, indole (dérivés du tryptophane) et phénols (dérivés de la phénylalanine)

- On trouve également une flore méthanogènes : métabolise l’hydrogène, le lactate, succinate, éthanol (Methanobrevibacter, Méthanosphaerea)

- et sulfato-reductrices : sulfate, sulfites, thiosulfates, nitrates: Desulfovibrio, Desulfobacter, Desulfobulbus, Desulfomonas, Desulfotomaculum

Les bactéries sulfato-réductrice peuvent se multiplier rapidement en cas d’inflammation, car elles peuvent se nourrir des mucopolysaccharides sulfatés, ces mucines sont produites pendant l’inflammation.

Compétition possible entre flore sulfato-reductrices et méthanogènes pour l’hydrogène.

Importance d’une bonne flore :

Une bonne flore peut reverser les effets nocifs de médicaments

Expérience :

1) Rats prise d’anti-inflammatoire non stéroïdien développent des ulcères duodénaux que si bactéries de putréfaction

2) Souris administration de substance cancérigènes développent cancer du foie si flore de putréfaction. Effet contré par prise d’antibiotique. Protection bactéries saccharolytiques.

Chap 4 : Microflore et inflammation

Hyp : dysbiose -> apparition des pathologies intestinales inflammatoires.

Le sujet normal résiste à l’activité de la microflore grâce à une réponse inflammatoire contrôlée et une barrière intestinale relativement imperméable. Il y a un équilibre entre les bactéries et les protections de l’organisme. Cet équilibre peut être perturbé par des stimuli environnementaux ou des anomalies immunitaires entrainant une inflammation chronique.

Rats présentant l’antigène HLA-B27 (gène présent fréquemment chez les patients souffrant de spondylarthrite ankylosante), présentent également une inflammation intestinale persistante.

Spondylarthrite ankylosante : Les rats ayant l’antigène HLA-B27 ne déclenchent une spondylarthrite que si ils ont une flore intestinale. Hypothèse sur l’apparition de la maladie : Perte de tolérance aux bactéries intestinales, possiblement via un dysfonctionnement des cellules présentatrices d’antigènes.

Chez l’homme, la spondylarthrite est corrélée à des taux IgA contre Klebsilla pneumonia et la levure saccharomyces cerevisia.

Favoriser par la flore de putréfaction. Bacteroides vulgartus et d’autres bactéries de la flore de putréfaction serait impliquées, en revanche diminution de la flore de fermentation

Maladie intestinales inflammatoires : recto-colite x4 si beaucoup de graisse saturé, Crohn x2 si absence d’allaitement maternelle. Crohn également corrélé avec une augmentation de la putréfaction. Défaut du gène NOD2 (reconnaissance bactérienne : LPS, peptidoglycan) augmente les risques de crohn sans doute via une réaction immunitaire inappropriée en réponse aux stimuli excessifs issus d’une flore intestinale déséquilibrée. Facteurs influençant : tabagisme facilitant et appendicectomie précoce protecteur.

Fréquence de la maladie de Crohn est proportionnelle à l’hygiène (parallèlement diminution de la flore de fermentation)

Chap 5 : Microflore et allergie

Hypothèse : Besoin d’une stimulation adéquat du système immunitaire par la microflore pour construire l’immunité

Atopie : aptitude à représenter des manifestations cliniques au contact d’allergènes banals (rhinite, asthme, urticaire, eczéma, allergies alimentaires)

Allergie, diminution de lactobacillus

Nourri au sein : Bifidobacterium, Lactobacillus, streptococcus

Nourri au biberon : Bifidobacterium 40% et Bacteroides 40% + Staphylococcus, Escherichia, Clostridia

Hypothèse de l’hygiène : Enfants vivants à la campagne rencontrent plus d’endotoxines bactériennes et présentent moins de risque de rhume des foins. Epidémie de rhume des foins suite à l’ère post-industrielle

Mycobactérie présent dans la poussière stimule l’immunité cellulaire (th1 helper) alors que les vaccinations stimulent l’immunité humorale (lymphocytes T helper Th2)

Recherche en cours : Les infections précoces dans l’enfance stimuleraient les lymphocytes Th1 (immunité cellulaire) production cytokines qui contrecarre les réponses allergiques véhiculés par les Th2.

Cas clinique : ?? affections auto-immune Th1 augmentent et infection par vers Th2 diminue. ImplicationIL10

Système immunitaire inné : Les Toll like receptors sont activés par un motif antigénique propre aux gram – et déclenchent des voies de signalisation aboutissant au contrôle des cytokines produites dans la paroi intestinale

Augmentation des affections allergiques : exposition réduite aux microbes, modification de l’alimentation, prise d’antibiotique.

Stress :

Pathologie	fermentation	putréfaction
Spondylarthrite	 	 Peptostreptococcus Eubacterium Coprococcus Escherichia
Crohn	 	 Peptostreptococcus Eubacterium
allergie		clostridium
Cancer hormono dependant	βglucuronidase

Chap 6 : Rôle des enzymes bactériennes

- Hydrolyse des sucres complexes : β-fructosidase , β-glucuronidase, β-glucosidase, β-galactosidase

- Réactions chimiques diverses : azoréductase, nitroréductase, 7α-d	eshydrogenase, hydrolase des sels biliaires, sulfatases

Effet néfaste d’un excès de bactéries de putréfaction :

- Impossibilité d’éliminer efficacement certains déchets : Pour que certains déchets soit éliminés de l’organisme, comme par exemple des vieilles molécules d’oestrogene ou la bilirubine, le foie leur greffe un acide glucuronique. Suite a la detox, on retrouve ces composés conjugués dans la bile puis les intestins. Les bactéries productrices de βglucuronidase détachent les molécules prisonnière de l’acide glucuronique et induisent leur réentrée dans l’organisme. (Cycle enterohepatique).

Les espèces produisant la βglucuronidase : Bacteroides, clostridium, Escherichia = putréfaction favorisé par excès de viande et de graisse.

βglucuronidase associé à une augmentation des cancers hormono-dependant

Baissé avec probiotique et prebiotique et calcium D-glucarate.

Déficit de l’enzyme de glucuronisation : syndrome de Gibert (excès de bilirubine) , absence total : syndrome de Crigler-Najjar (grave).

Transformation de composants inoffensifs en composant toxique comme des colorants et composés nitroaromatiques par les Azoreductases et nitroréductases produits par bacteroide, clostridium, Eubacterium transforme des. Effet diminué par les lactobacillus

Toxicité des sels biliaires secondaire

Acides biliaires :

Phase I : cholestérol transformé par le P450 en acide cholique ou acide chénodeoxycholique (acides biliaires primaires)

Phase II greffe une glycine -> sels biliaires glycino-conjugués ou Taurine : sels biliaires tauro-conjugués

Ac biliaire secondaire : 7α-déshydrogénase d’origine bactérienne transforme les sels biliaires primaires en ac deoxycholique (toxicité hépatique) et acide lithocholique (impliqué dans le cancer du colon)

Si ces composé sont deconjugué (perte de taurine et glycine), ils vont être recapté par le cycle enterohépatique et subir une sulfoconjuguaison par le foie, l’acide lithocholique sera ainsi transformé en acide sulfolithocholique (un acide biliaire tertiaire) et éliminé ou redéconjugué par des sulfatase produite par pseudomonas aeruginosa

Les sels biliaires primaires peuvent être transformés en sels biliaires secondaires par la flore de putréfaction promoteur de cancer

7α-déshydrogénase produite par Clostridium, eubacterium, Esherichia, pseudomonas, bacteroides, bacillus

Sulfatase produite par pseudomonas aeruginosa

Déconjuguaison des sel biliaires qui perdent leur action d’émulsion

Hydrolase chez bacteroides, proteus, clostridium, streptococcus, peptostreptococcus

Effet bénéfique des bactéries de putréfaction

Favorise l’absorption de certaines molécules. Avec la βglucosidase : Hydrolyse les glucides de molécules et favorisent leur absorption – comme les isoflavone de soja : génistine et la daidzine qui vont être transformé en daidzéine et génistéine.

Egalement synthétisé par la flore de putréfaction. Donc il faut un minimum de cette flore.

Et la flore de fermentation :

Effet néfaste :

Mauvaise digestion des graisses par déconjuguaison des sels biliaires. Bifidobacterium et Lactobacillus capable d’enlever la glycine et la taurine des acides biliaires qui perdent ainsi leur effet emulsifieur. Déficit de digestion des lipides

Effet bénéfique : aide à la digestion

βfructosidase produite par Bifidobacterium digérer les fructanes (FOS comme l’inuline)

Ex β-fructosidase produit par bifidobacterium permet la digestion des fructanes FOS (chaine linéaire de fructose). Surtout représenté par l’inuline

Il ne s’agit donc pas d’éliminer un flore au profit d’une autre, mais de rechercher un équilibre

Chap 7 : rôle des enzymes digestifs

Digestion incomplète en amont -> augmentation des nutriments pour les bactéries -> dysbiose. Maldigestion favorise les ballonnements

Salive : lipase

α-amylase transforme les polysaccharides en plus petite unités : en α-dextrine, maltriose, maltose

La mastication aide cette enzyme à avoir accès aux molécules et augmente la quantité de salive. Pas assez de mastication : les enzymes suivantes ne pourront pas attaquer de manière efficace. Conséquence : dysbiose , prolifération fongique due à la malabsorption des hydrates de carbone.

Estomac :

Hcl tue de nombreuses bactéries. Hypochondrie : prolifération de bactéries dans le grêle : SIBO

Hcl dénature les protéines et offrent de nombreux points d’accès aux protéases

HCL change la conformation du pepsinogene et dégage son site actif, il commence alors le clivage d’autres pepsinogenes en pepsine

HCL active la pepsine qui prends le relai et transforme les autres pepsinogenes en pepsine

Suc gastrique : Présence d’une lipase et de la chymosine (précipite la caséine)

Prolifération bactérienne en cas d‘une digestion incomplète des protéines

Rappel

Pepsine hydrolyse les liaisons peptidiques avant les aa aromatiques

Pancreas :

- α-amylase pancréatique

- Lipase pancréatique

- Peptidase (endopeptidase : trypsine, chymotrypsine, élastase, exopeptidase : carbopeptidase A et B), sécrétés sous forme inactives et activées par un clivage par la trypsine. Elle même préalablement activée par une entéropeptidase de la bordure en brosse

- Ribonuclease et désoxyribonucléase

Le stress diminue les secretions digestives (salive, suc gastrique et pancréatique)

Intestin grêle :

- Sucre : A l’entrée dans l’ingestion : sucre -> oligosaccharide et disaccharide par l’amylase salivaire et pancréatique.

La Maltase, tréhalase, saccharse, lactase finissent de découper ces sucres en sucre simple hexose, pentose

- Protéines :

15 peptidases : endopeptidase, exopeptidase (aminopeptidase et carbopeptidase) comprenant l’enteropeptidase qui active la trypsine

Il peut cependant avoir des peptides résistants ex gliadine

Chaque peptidase coupe le peptide à un endroit particulier : des peptides peuvent être résistant à la digestion si leur séquence en acide aminé demande une forte présence d’une enzyme peut représentée.

Intolérance au gluten ou produit laitier : Implication de l’aminopeptidase P et W : coupent peptides se terminant par la proline ou la tyrosine comme c’est le cas pour des casonorphines et certaines gliadorphine (opioïde alimentaire dérivés de la caséine et de la gliadine)

Et de la Dipeptidase peptidase IV coupe en avant de la proline coupe entre autre l’endomorphine, la substance P et des casonorphines

Un déficit de ces peptidases peut poser des problèmes dans la digestion du lait ou des glutens.

- Acide gras : Phospholipase, phosphatase alcaline coupe les phospholipides en acides gras, glycérol, phosphate.

- Acides nucléiques : Nucleosidase : casse les molecules d’adn, arn … en bases libres, ribose, phosphate

- Vitamines conjuguées : deconjuguases

Auto-immunité frappe fréquemment l’activité pancreatique ou les cellules de la crypte gastrique (diminution secretion HCL, de pepsine ou de facteur FI en fonction de l’atteinte)

Chap 8 : Entérocytes et colonocytes

Structure plissée : Plica + Villosité et cryptes de Lieberkuhn + microvillosité

Structures :

Villosité :

Cellules épithéliales = entérocytes

Cellules calciformes produisent le mucus

Zones plaques de Peyer

Cellules M présentent des antigènes présents dans la lumière intestinale aux Lymphocytes naïfs

Cryptes :

Cellules indifférenciées qui donneront naissance aux entérocytes

Cellules calciformes

Cellules endocrines produisent la sécrétine et la cholécystokinine, la motiline, la somatostatine, le GIP

Cellules de Paneth

Cellules :

Cellules épithéliales :

Liaisons serrées

- Absorption des nutriments grâce aux enzymes et transporteurs fichés dans leur bordure en brosse

- Récepteurs permettant d’identifier les antigènes des bactéries Toll-like receptor

Transforment les IgA dimerique produits par les plasmocytes en IgA secretoire

- Production de β-défensine

- Production de cytokines pro inflammatoires IL6, IL7, IL8 et le TNFalpha. Les cellules épithéliales signalent la présence de bactéries pathogènes et commensales au système immunitaire

- Il y a des récepteurs aux cytokines sur les entérocytes IL2, IL4, IL7, IL9

-Modulation de l’expression génique en fonction de la présence de certaines bactéries

Cellules calciformes :

- Produisent le mucus (couche d’hydrate de carbone riche en glycoprotéine : mucines )

Le mucus s’accroche au glycocalyx (intégré dans la membrane des entérocytes)

Production influencée par les bactéries pathogènes : augmentation par toxine cholérique, diminution par H. Pylori et Clostridium difficile

- Produisent les peptides en forme de trèfle (pS2, SP, ITF) protègent l’épithélium des toxines, des lésions et accélèrent sa réparation

Cellules de Paneth : fond des cryptes

- Production des α-defensine, lysozyme et phospholipase A2 sécrétoire = antimicrobien

- Régulation de l’angiogenèse. Stimulés par des motifs antigéniques LPS, l’acide lipotéichoique, muramyl dipeptide.

Peptides antimicrobiens et immunité innée :

Défensine (structure : 3 ponts disulfures, LL-37) et cathélicidines (α-défensine HBS-5 et HBD-6 secretés par les cellules de paneth et β-défensine HBD-1 et HBD-2 secrétés par les cellules intestinales)

Certaines bactéries diminuent la production de ces peptides

Entérocytes et glutamine :

- Carburant des entérocytes : la L-glutamine

- Stimule la prolifération des cellules épithéliales via EGF et des entérocytes via IGF-I

- Carburant des cellules immunitaires

Source de glutamine : viande, poisson, œuf

Colonocytes et butyrate

- Producteur : Bifidobacterium mais aussi Eubacterium, Clostridium (à la fois putréfaction et fermentation)

- Absorbé et utilisé par les mitochondries pour synthétiser l’ATP (fourni 10% de l’énergie) et 70% de l’énergie du colonocyte.

- Rôle protecteur des cellules épithéliales intestinales contre le stress oxydatif, stimule l’apoptose des cellules néoplasiques (contré par des acides biliaires déconjugués : acide deoxycholique et acide chénodéoxyxholique -> carcinogenèse)

Partie II : Pathogènes et Leaky Gut

Chap 9 : Prolifération bactérienne

Prolifération bactérienne dans l’intestin grêle (Small Intestine Bacterial Overgrown = SIBO). Profil bactérien au niveau de l’iléon correspond à la flore colique (quantativement et qualitativement). On peut avoir des grands taux d’absorption de vitamine.

Certaines formes sont asymptomatiques d’autres -> diarrhée chronique, syndrome de malabsorption, perte de poids.

Diagnostics : taux de vitamines et test respiratoire de l’hydrogène après ingestion de 50g de glucose.

Souvent associé :

- Syndrome du colon irritable ou IBS. Guérison chez la moitié des sujets ou la prolifération bactérienne de l’intestin grêle est éradiquée par un antibiothérapie

- Cirrhose hépatique : prolifération bactérienne se rencontre dans plus d’un tiers des cas

- Fibromyalgie et syndrome de fatigue chronique

- Diarrhée diabétique chronique

- Maladie de coeliaque latente : anticorps IgA anti-gliadine quantité accrue

Le SIBO serait à l’origine d’un quart des cas dans les syndrome de malabsorption et de diarrhée chronique

Le SIBO survient souvent suite à l’hypochlorhydrie causée par la gastrite atrophique et pendant traitement par inhibiteurs de la pompe à protons (moindre stérilisation du bol alimentaire et pH duodénal plus élevé)

L’hypochlorhydrie provoque également une prolifération bactérienne dans le duodénum.

Oméprazole (inhib pompe à proton), cimétidine	(antihistaminique H2)

Diverticule du colon :

La diverticulose : multiplication des diverticules causées par des hernies sacculaires muqueuses surtout dans la partie terminale du colon descendant et sigmoïde.

La diverticulite : inflammation d’un ou plusieurs diverticules, peut induire à l’occlusion, la perforation, la formation d’abcès ou la fistulisation. Risque vital !

Facteurs favorisant la diverticulose : constipation, alimentation pauvre en fibres.

En prévention, un rééquilibrage de la flore peut s’avérer utile.

Prolifération des bactéries putrefiantes :

Palpation abdominale + plainte dans région descendant

Présence de gaz malodorant (idem qu’une prolifération de levure)

Prolifération des bactéries fermentantes :

Ballonnement peut prendre des proportions étonnantes. Odeur varie du neutre à désagréable dépendant aussi de la présence concomitante de levures

Prolifération des bactéries sulfato-reductrices :

Utilisent le sulfate (aussi sulfites et nitrates) qu’elles transforment en sulfure

Odeur sulfure d’hydrogène = sent l’œuf pourri

Développement : préférence dans le colon gauche. Les mucines produites dans le colon contiennent davantage de sulfate.

Sulfure d’hydrogène est toxique pour la muqueuse du colon car il inhibe l’oxydation du butyrate

Bactéries peuvent être impliquées dans la colite ulcero-hémorragique et spondylarthrite ankylosante

Prolifération des bactéries méthanogènes :

Développement : préférence dans le colon gauche.

Compétition avec les bactéries sulfato-reductrices pour l’hydrogène, elles protègent donc de leur toxicité.

Peu de ces bactéries dans les populations blanches occidentales. Les population noires sont protégées contre les maladies inflammatoires.

Acides biliaires primaires inhibent les bactéries méthanogènes.

Chap 10 : Prolifération fongique

Candida albicans espèce la plus fréquente

Met en jeu le pronostic vital pour des patients immunodéprimés, elle pénètre dans l’organisme. Résistent de plus en plus au fongicides

Existe de nombreux autres candida

Elles ont la particularité de créer des biofilms : production d’une matrice de substance polymérisée où se fixent les micro-organismes. Une fois le biofilm déployé les bactéries et levures hébergées sont moins exposées aux antibiotiques et antifongiques.

Ex : Candida parapsilosis et d’autres tissent des biofilms autour des cathéters aux soins intensifs. Problème important dans les maladies nosocomiales.

La lactoferrine (lait et colostrum) bloque le développement des biofilms

Autres genres de levure: Blastoschizomyces capitatus, Saccharomyces cerevisiae

Attention aux utilisation massif de fongicides : augmentation des résistances, et laisse le champs libres à d’autres pathogènes qui peuvent être plus virulents.

Symptôme variés : Cas de psoriasis et dermatique atopique souvent associés une prolifération fongique.

Chap 11 : Infection par les protozoaires

les amibes : tropicales et cosmopolites (troubles digestifs, articulaires et cutanés et buccales)

les flagellés

les ciliés

les sporozoaires

Microorganismes commensaux mais leur déséquilibre peuvent être à l’origine de pathologie.

Leur présence et leur prolifération témoigne d’un déséquilibre de l’écosystème intestinal

Peuvent être a l’origine de nombreux troubles : digestif, articulaire, parodontite

Chap 12 : Infection par les helminthes

= Vers parasites

Vers plats : Plathelminthes :

-Cestodes : Ténia du Bœuf, Ténia de porc, viande mal cuite,

Ténia du porc peut entrainer une cysteriose

Autres types de ténia : Diphyllobothrium latum, Dipylidium caninum, Echinococcus granulosus, Hymenolepis nana)

- Trématodes (douve du foie Fasciola hepatica)

Vers ronds : Némathelminthes : Nématodes oxyure

Symptôme : fatigue, trouble pulmonaire et digestif, hyperéosinophilie

Chap 13 : Immunité et tube digestif :

Bouche :

-Mucines : glycoprotéine riche en soufre constituant de la couche de mucus, les bacteries y adhérent via leur leptine et peuvent ainsi s’y fixer

- sIgA

- Lysozyme : enzyme antibactérienne, 6 sites chargés positivement qui fixent les micro-organismes

- Peroxydase salivaire : enzyme antibactérienne produisant des radicaux libres

Les glandes salivaires produisent l’ion thiocyanate SCN- qui est transformé par la peroxydase en acide hypothiocyaneux HOSCN qui oxyde les groupements thiols –SH des enzymes microbiennes

- Les cystatines salivaires : nous protège contre les peptidase bactériennes

- Histatine : antibacterien et antifongique

- Les protégrines : antibacterien

- β-défensine

- La cytokine EGF stimule production de mucus dans la bouche, et HGF

L’estomac : Hcl, désinfecte le bol alimentaire

L’intestin :

Motif antigénique reconnu par des récepteurs

LPS (bactérie gram -) -> TLR-4, NOD-1

LTA acide lipotéichoique (gram +) -> TLR-4

PGN Peptidoglycan (Gram +) -> TLR-2, NOD-2

Lipoarabinomannan (Mycobacterie) -> TLR-2

Mannans et mannoproteines (levure)

ADN à motif CpG (bactérie) -> TLR-9

ARN double brin (virus) -> TLR-3

flagelline du flagelle bactérien -> TLR-5

Levures candida sont reconnues par le TLR-4 et TLR-2

La liaison du récepteur à son ligand entraine la transcription de cytokine pro inflammatoire via le facteur NF-kappaB

Cellules MAIT :

Catégorie spéciale de LT de la lamina propria. Immunité innée car reconnaissent un nombres restreints d’antigènes.

Glycocalyx : réseau filamenteux qui empêchent les bacteries et macromolécules d’approcher la membrane. (et de stimuler inutilement les TLR)

GALT :

MALT : mucosal associated Lymphoid Tissue, organe lymphoïde secondaire au même titre que la rate et les ganglions. Tapissent la face interne des muqueuses de l’organisme.

GALT : le MALT des intestins s’appelle le GALT (G pour gut). Très étendu, il représente la plus grande masse lymphoïde de l’organisme.

Lymphocytes peuvent être isolés dans la lamina propria de l’intestin ou amassés dans des follicules (plaques de Peyer)

Cellules M :

Au niveau des plaques de Peyer, elles n’ont pas de glycocalyx et de bordure en brosse mais des sortes de doigts de gant.

Echantillonnent les antigènes et les transmettent de autre coté de leur membrane ou ils sont présentés au LT et LB , présents dans des invaginations de leur membrane

Les antigènes sont présentés directement aux LT ou LB naïf ou indirectement via les CPA qui les présentent à leur tour aux Lymphocytes.

Les LT s’activent et produisent des cytokines qui activent les LB et produisent les IgA. Qui vont être transformé en sIgA par les entérocytes

IgA : anticorps des secrétions muqueuses. Produit par les plasmocytes puis secretés par les entérocytes. Ils se lient à l’antigène et le bloquent. Ils sont aussi capable de se lier à un antigène qui aurait traverser la muqueuse intestinale et le faire ressortir par le même mécanisme utilisé pour la secretion

Cellules dendritiques :

Les cellules dentritiques sont des CPA qui sont capables d’émettre des prolongements cytoplasmiques à travers la membrane et échantillonner directement les antigènes.

Les cellules dendritique et cellules M peuvent donc également être une porte d’entrée aux antigènes, au même titre qu’un défaut de la jonction serrée.

Chap 14 : Leaky gut syndrome

=perméabilité de la muqueuse par ouverture des jonctions serrées

Permeabilité est mesuré par une augmentation d’excretion urinaire d’un sucre dimerique/sucre simple le rhamnose

Les causes du Leaky gut :

- Zonuline.

Jonction serrée : une trentaine de protéines impliquées (claudine, Occludin, zonula occludens, JAM…)

Zonuline desassemble la jonction.

Une secretion accrue de zonuline par les entérocytes est observés lors de la présence d’entérobactérie, de gluten et dans la maladie de coeliaque.

- Ischémie intestinale :

Cause de l’effet délétère :

- Au cours de la répercussion, l’enzyme xanthine oxydase transforme l’hypoxanthine en xanthine puis en acide urique, est une source majeur de radicaux libres

Allopuridol inhibe la xanthine oxydase et scavenger de OH et acide hypochloreux

- Les enzyme proteolytiques s’attaquent aux glycoproteines de la bordure en brosse et exposent les jonctions serrées à l’attaque de la trypsine

- Un effort physique intense entraine donc une augmentation de la permeabilité

-Déficit de Glutamine et de Butyrate :

Chez le rat, la privation de glutamine -> mort par apoptose des enterocytes

Effet de la Glutamine

- Reverse la hausse de permeabilité observée dans les cas suivant :

- induite par les AINS

- patient atteints du sida

- patients nourris en parenterale

- chimiotherapie

- et elle reduit la translocation bacterienne

Butyrate réduit la perméabilité colique chez l’animale

- Deficit en IgA et denutrition :

Diminution des IgA -> augmente la perméabilité

Ex infection fréquente -> épuisement des IgA

Souffrance des entérocytes -> moins capables de relarguer les IgA

Manque d’IgA et infection -> altération des entérocytes -> dénutrition -> cercle vicieux

- Déficit et anomalies du glycocalyx

Il protège des enzymes protéolytiques.

- Cas des nouveau-nés :

Immaturité de la muqueuse :

-> Immaturité de la barrière : immaturité des mucines, et soudure incomplète des jonction serrés (utiles car les IgA de la mère contenu dans son lait passent ainsi et protègent les muqueuses) maturité complète à 2 ans.

Cette perméabilité décroit plus vite chez les bébés nourries au sein.

Lait maternel -> plus IgA

-> Et immaturité des défenses immunitaires

- Cas du jeune :

Augmentation de la perméabilité après 48h

- Cas des bactéries commensales :

Composition de la flore modifie la perméabilité.

Probiotiques réduisent l’hyperperméabilité intestinale et une hausse des IgA

Leaky gut : augmentation de l’absorption paracellulaire et diminution de l’absorption cellulaire due a la souffrance des enterocytes.

Chap 15 : Conséquences du leaky Gut

Entrée d’antigènes : L’entrée en quantité importante par voie paracellulaire s’oppose à l’entrée parcimonieuse et sélectif réalisé par les cellules M et dendritiques

L’excès de stimulation des défenses immunitaires nous rend réactif à des molécules habituellement bien tolérées : atopie. La surcharge entraine un accroissement des erreurs alors que la multiplication des rencontres entrainent des mimétismes moléculaires : auto-immunité. La formation de nombreux complexe antigène-anticorps suscite leur dépôt dans les membranes synoviales : inflammation

- Leaky gut et allergie au lait de vache

L’intolérance au lait de vache est associée à une perméabilité accrue et une souffrance des entérocytes.

- Leaky gut et allergie au gluten : La gliadine provoque une augmentation de l’ouverture des jonctions serrées par la liberation de zonuline.

- Leaky gut et maladie de Crohn

Maladie inflammatoire et auto-immune touchant l’intestin grêle débuterait par un leaky gut. Une augmentation est d’ailleurs observée avant les poussées de la maladie.

- Leaky gut et recto-colite ulcéro-hémorragique : Observation d’une augmentation de la perméabilité.

- Leaky gut et maladie auto-immune :

Mimétisme moléculaire : Molécules du soi qui ressemblent à un antigène. L’entrée massif d’antigène augmente la probabilité de rencontrer un antigène de structure similaire au soi, ce qui déclencherait des maladies auto-immunes.

Ex Les HLA sont des glycoprotéines exprimées à la surface des leucocytes. Ils présentent des peptides aux lymphocytes ce qui déclenchent la réaction immunitaire. Un peptide étranger ou alimentaire ressemblant aux peptides habituellement présenter peut entretenir la réaction immunitaire

Homologie de structure du virus d’Epstein-Barr et une protéine de la myéline serait à l’origine de la sclérose en plaque. Ils sont présentés par des molécules HLA très proches HLA-DR2b et HLA-DR2a.

Entrée de pathogènes :

- Translocation bactérienne : entrée de pathogène par la muqueuse intestinale

Peut être due à une rupture de l’équilibre de l’écosystème gastro-intestinale, une augmentation de la perméabilité, des déficits dans les défenses immunitaires.

Aujourd’hui consensus sur l’importance de la barrière intestinale chez les patients gravement malades et ceux exposés au choc septique.

- Translocation fongique : voie d’entrée pour le Candida vers le sang.

Infection fongique : 15% de toutes les infections nosocomiales

- Translocation amibienne : translocation au niveau du colon. Elles s’y adhèrent par une lectine (protéine se liant à un motif oligosaccharide)

Entrée de toxines :

- Mycotoxines : toxines produites par les levures déclenchent des signes neurologiques.

Détoxification :

Chaque molécule d’urée produite coute 3 atp. La detox implique un coup d’atp exorbitant.

Signe d’une surcharge hépatique :

Fatigues, nausée, céphalées, état grippal, intolérance a l’alcool, au café, trouble du sommeil, sensibilité anormal au odeur

Entrée d’aliments incomplètement digérés :

Due à :

Insuffisance pancréatique, Hypochlorhydrie, affection auto-immune touchant le pancreas ou l’estomac, stress reduit la quantité des sucs digestifs, mastication insuffisante, transit trop rapide du a des parasites ou réactions allergiques, régime alimentaire débordant les capacités enzymatiques, mauvaise absorption des graisses.

Chap 16 : Allergies alimentaires

Type de réaction face aux aliments :

- Intoxication alimentaire :

- Réaction alimentaire toxiques infectieuses : Ingestion d’un aliment infecté par des micro-organismes ex salmonellose , poulet mal cuit

- Réaction alimentaires toxiques sans infection : toxine produite par un micro-organisme (ce dernier n’étant plus présent) ex botulisme dans boite de conserve avariée

- Réaction alimentaires non toxiques :

- Réaction immuno-dépendante : allergie alimentaire (IgE et non IgE)

- Réaction non immuno-dépendante : intolérance alimentaires (enzymatiques, pharmacologiques, additifs)

Les allergies :

- Type I : Hypersensibilité immédiate : réaction intervient dans les 15 minutes suivants l’ingestion. Présence d’IgE

- Type II : Réaction se développe quelques heures après l’ingestion : de quelques heures à 3 jours. Implique une réaction de lyse cellulaire par des IgG

- Type III : Apparition de complexe antigène/anticorps pouvant se déposer dans les muqueuses ou dans les articulations synoviales.

- Type IV : Hypersensibilité retardée . Présence de lymphocyte T, réaction type cellulaire

Type I : peut être létale. Localisée, elle touche la peau ou les muqueuses : urticaire, dermatite atopique ou un oedeme de Quincke (gonflement du visage et du tronc), toux, asthme, rhinite, vomissements, diarrhée.

Type II : Muqueuse, tissus mais ne touche pas la peau.

-> Signes digestifs (Indigestion, ballonnement, nausée, pyrosis, reflux gastrooesophagien, éructations, gaz, aphtes, gastrite, colite, constipation ou diarrhée)

-> Signes respiratoires (toux, asthme, bronchite chronique, sinusite chronique, rhinite productive ou obstructive).

Contrairement à l’allergie de type I, signe d’atteinte d’autres tissus : douleur et raideur articulaires, otites, acouphènes, vertiges, conjonctivite, pollakiurie, crampes musculaire, vasculite, thrombocytopénie, néphropathie, céphalées, tendance dépressive, irritabilité, fatigue ( après un repas), idées confuses …

Intolérances alimentaires en principe pas d’intervention du système immunitaire :

- Intolérance aux lactoses : absence de lactase

- Intolérance aux amines biogènes ex histamine dans le poisson et le fromage, la tyramine dans la bière, la phényléthylamine dans le chocolat, la tryptamine dans les tomates, la sérotonine dans les bananes et les avocats, la spermidine dans la viande de porc et les germes de céréales

- Intolérance au Glutamate (restaurant chinois)

- Intolérance aux Sulfites dans le vin

- Intolérance aux Additifs alimentaires

Il existe aussi des allergies alimentaires IgE qui résultent d’une allergie croisée à certains pollens :

- Pollen de bouleau avec -> amande, pomme, poire, abricot, cerise, prune, nectarine, pèche, fraise, framboise, mure, châtaigne, noix, noisette, noix de coco, noix de muscade, pistache, mangue, kiwi, pomme de terre, tomate, aubergine, paprika, carotte

- Pollens d’herbacées avec -> Céleri, persil, fenouil, cerfeuil, carotte, scorsonère, coriandre, cumin, aneth, anis, paprika, chicon, laitue, endive, épinard, betterave, pissenlit, tournesol, camomille.

Différence type I et II

Type I IgE Symptôme immédiat Un seul aliment même a l’état de trace Peau et muqueuse Souvent chez les enfants et passe avec l’âge Détection : test cutanés et sanguins	Type II IgG Symptôme retardé Généralement plusieurs aliments en plus grande quantité Nombreux organes concernés Production d’endorphine en réaction, le patient recherchent les aliments incriminés Détection : sanguins

Allergie aux laits animaux :

Intolérance au lait de vache survient chez tous les sujets ayant une bordure en brosse déficiente. Il existe des allergie à IgE et IgG au lait de vache

IgG contre

des caséines, 4/5 des protéines du lait de vache (fraction moins importante chez l’homme)

Les protéines du petit lait : la β-lactoglobuline absente dans le lait humain. Chez l’homme, on trouve l’α-lactalbumine riche en tryptophane

Composition lait humain et lait de vache diffèrent : moins de caséine, riche en α-lactalbumine, en lysozyme, en omega3, en polyamines et oligosaccharides (développement de la microflore bifidobacterium), en alkylglycerols, en IgA, en lipase, en vitamines A,C et E.

Attention, lorsque la mère boit du lait de vache, des petite quantité de protéine de lait de vache se retrouve dans le lait.

Conséquence des allergies au lait de vache :

- Apparition du leaky gut. (souffrance des entérocytes et ouverture de la jonction serrée)

- Carence due a une mauvaise absorption et réaction immunitaire

Favorise l’ostéoporose. Car mauvaise absorption, carence en fer, B12, B9, cu, Mg, Ni

- Atopie : Observation cliniques :

enfant souffrant d’eczéma ont des taux élevés d’IgG au lait de vache

- Troubles immunitaires : auto-immunité

Peut être une relation entre diabète type I et lait de vache.

Hypothèses émises - similarité insuline bovine et insuline humaine.

Développement d’anticorps anti-insuline bovine, réaction

croisée avec l’insuline humaine

-mimétisme moléculaire entre la sérumalbumine bovine et

une protéine p69 des cellules beta des ilots de Langerhans

Digestion de certains variant de la β-caséine (présent chez certaines races bovines) libèrent après digestion un peptide opioïde β-casomorphine, qui lui est difficilement digérable car proline tous les 2 aa et peu d’enzymes sont capable de dégrader à coté des prolines (nécessite la dipeptidyl peptidase IV), ce peptide opioïde a un effet immunosuppresseur.

- Troubles immunitaires : inflammation

Observation des naturopathes, non prouvé

Lait de vache augmentation de l’inflammation des muqueuses : rhinites… Production accrue de mucus. Muqueuses sont liées

- Perturbation digestive : Constipation, reflux gastro-oesophagien

Allergie au gluten : Implication des IgA et IgG

Gluten : masse protéique élastique restante après l’extraction des amidons.

Famille constituée de nombreuses protéines : Albumine, globuline, prolamine

Parmi les prolamines : gliadine dans le blé, l’hordéine dans l’orge, la sécaline dans le seigle.

La maladie de Coeliaque : Les réactions allergiques dans la maladie de coeliaque apparaissent au contact de ces 3 céréales. Bien que l’avoine contienne aussi du gluten, elle n’est pas considéré comme causant la maladie de coeliaque

Il faut également un terrain génétique HLA-DQ2 et HLA-DQ8

La réaction inflammatoire résultant de l’attaque auto-immun entraine l’atrophie des villosités et l’hyperplasie des cryptes.

Base moléculaire de l’action toxique de ces protéines

Digestion de la gliadine libère un peptide de 33 acides aminés (contenant 13 prolines et 10 glutamines), l’abondance des prolines nécessites bcp de dipeptidyl peptidase IV (peu représenté)

Un fois dans la lamina propria le peptide se lie a une transglutaminase et est phagocyté par une Cpa, scindé en 3 épitopes et présentés par les HLA-DQ2, DQ-8. Ainsi présenté, ils sont reconnu par les lymphocyte CD4+ -> cytokine -> atrophie des villosités.

Bases moléculaires de l’augmentation de la perméabilité :

Zonuline, physiologiquement est vraisemblablement utile pour ouvrir la jonction et permettre le passage d’un flux liquide repoussant les envahisseurs.

La gliadine induit la libération de zonuline

Conséquence des allergies au gluten :

- Perte de fonction d’absorption entraine des symptômes carenciels (Ostéopénie chez les patients atteints de coeliaque, Anémie, symptôme très fréquent (Fer, B9), déficit en micronutriments entraine la fatigue, les troubles d’infertilité

Perte de fonction de barrière, entraine des troubles immunitaires (atopie, auto-immunité, inflammation)

- atopie. Nombreux malades ont une dermite herpetiforme

Patients psoriadiques ont des IgA et G élevé contre la gliadine

- Auto-immunité : relation probable diabète de type I et maladie de coeliaque : patient diabétique ont 20x plus de risque de déclencher une maladie de coeliaque. Les malades coeliaques ont fréquemment des anticorps anti-thyroidiens et anti cellule beta des ilots de Langerhans.

- Inflammation : IgA contre la gliadine chez les arthrites psoriasiques

- troubles cérébrales : des anticorps anti-gladine réagissent avec des structures vasculaires cérébrales entrainant de nombreux troubles : céphalées, changement d’humeur, anxiété, schizophrénie, autisme, troubles d’apprentissage, et cognitif

- Perturbation digestives

- Autres pathologies : cancer (Risque accru de lymphomes non hodgkiniens, d’adénocarcinome de l’intestin grêle, cancer de la bouche, du pharynx, de l’œsophage, de mélanome), Jéjunite ulcerative, insuffisance pancréatique exocrine, augmentation des transaminases hépatiques

Autres conséquences des allergies alimentaires en général

Perturbations digestives : reflux et constipation corrélée à la présence d’allergie

Syndrome du colon irritable (IBS) a été proposé comme la conséquence d’une intolérance alimentaire. Hypothèse très critiquée. L’anxiété et la dépression peuvent augmenter de l’activité du système nerveux autonome pouvant modifier la motilité intestinale

Fatigue et troubles immunitaires retrouvés fréquemment chez les allergiques

Allergies alimentaires et autisme

Pour une forme d’autisme : avec régression après une période de croissance normale. Peut-être une origine nutritionnelle de cette forme d’autisme. Souvent associé à de la diarrhée, de douleurs abdominales, de ballonnements

Anomalie de l’écosystème intestinal et de la digestion : Infiltration lymphocytaire dans l’épithélium intestinal

Déficience en Ig A, insuffisance digestive des disaccharides, dysfonction de la dipeptidyl peptidase, diminution d’aminopeptidase P et W, augmentation de la perméabilité intestinale, IgA contre la caséine élevée, dépôt d’IgG, sulfatation hépatique affaiblie (phase II)

Implication possible de peptide opioïde généré par une digestion incomplète.

Caséine -> casomorphine et Gliadine -> gliadorphine

Intérêt de supprimer lait et gluten chez les autistes

Chap 17 : circonstances du leakky gut

Observation du leaky gut dans les cas suivants :

Infection :

- Sprue tropicale -> malabsorption, carence vitaminiques, anomalies de la muqueuse de l’intestin

- SIDA -> diarrhée

- Colite pseudo-membraneuse : colite sévère suite à la prise d’antibiotique. Prolifération de Clostridium difficile qui secrète des toxines qui détruisent les jonctions serrées

- Prolifération bacterienne de l’intestin grêle (SIBO).

- Dysbiose intestinale : infection bacterienne, fongique, amibienne, helminthiques, virales

Pathologie :

Diverses : Prématurité, affections dermatologique (dermatite herpetiforme, eczéma, psoriasis), diarrhée diabétique, malaria, leucémie myeloides aigue, claudication intermittente, autisme, mucoviscidose, cirrhose du foie

Accidentelles : brulure, hémorragie

Iatrogènes : chirurgie digestive, soin intensif (irrigation intestinale réduite et

alimentation parentérale), alimentation parentérale, chimiotherapie, radiothérapie, stress physique et psychique, anti-inflammatoires non stéroïdiens

Toxique : alcool (endommage le cytosquelette des enterocytes -> perturbe

jonction serrées et secretion d’IgA), huile de ricin détruit les villosités

Partie III : Diagnostic et traitement

Chap 18 : Diagnostique cliniques

Symptômes : de la dysbiose due à une prolifération fongique

Symptômes digestifs : pas nécessairement

Diarrhée : fréquente chez les dysbioses à levure (diarrhée explosive). Selles non moulées retrouvées en cas de déséquilibre de la microflore, pathologie infectieuse ou inflammatoire., Constipation : peut être retrouvé en cas de prolifération de levure. On trouve préférentiellement une alternance diarrhée-constipation. Ballonnement : chez les patients en dysbiose, prolifération fongique, et de bactérie de putréfaction, Gaz et éructations, Spasmes et crampes, Pyrosis (inflammation de la muqueuse recouvrant le cardia, dysfonction -> remontée acide. Du à un excès ou à un manque d’acide chloridrique.), Halitose (Langue chargée : souvent corrélé à une prolifération fongique

Surcharge hépatique : du à la permeabilité et à l’entrée massive de toxine)

Symptôme neurologique :Sans doute du à l’action des mycotoxines sur le systèmes nerveux : Fatigue (dépense énergétique immunitaire et detox hépatique , et une action des mycotoxine sur le cerveau), Dépression , Humeur fluctuante, céphalée, pensée confuses, perte de mémoire, anxiété, narcolepsie, Insomnie, attirance pour les sucres.

Symptôme dermatologique

La dysbiose fongique favorise d’autres infections fongiques de la peau, muqueuse et phanère. Epidermophytose (pied d’athlète), trichophyties (cuir chevelu, onychomycose (ongle), muguet (muqueuse buccales) …, Acné, psoriasis, urticaire, eczéma, erysipele, prurit

Symptôme infectieux

Colonisation intestinale des levures entrainent une baisse de l’immunité

Peut être un rôle immunosuppresseur des mycotoxines

Infections chroniques : Otites, sinusites, rhinite, pharyngites, laryngite, bronchite, cystite, prostatite, vulvo-vaginite …

Symptômes inflammatoires : Atopie (allergie cutanées, allergies alimentaires, asthme), auto-immunité (crohn, rectocolite, pancréatite, atteinte de la thyroïde), Inflammatoire (lupus, polyarthrite rhumatoïde)

Symptôme algiques : Arthralgies, lombalgie (même circuit nerveux que les intestins : racines lombaires), tendinite, fibromyalgie, tétanie.

Symptômes particuliers aux femmes :

Cystite, vulvo-vaginite, Dysménorrhée, syndrome prémenstruel, perte de la libido, endométriose, infertilité, dyspareunie (douleur pendant l’acte)

Symptômes particuliers aux enfants : en plus des affections ORL récidivantes, irritable, insomnie, déficit d’attention, hyperactivité, autisme

Symptômes des sportifs : fatigue, difficulté à évacuer les toxines, démotivation

Symptômes des amibiases : anorexie, bruxisme, colon spastique, cernes bleuâtres sous les yeux

Symptômes des helminthiases : prurit anal, cernes bleuâtres sous les yeux, perte de poids

Chap 19 : Diagnostics coprologiques

Observation macroscopique :

Coprologie fonctionnelle

- Couleur des selles : Etat de dégradation de la bilirubine (jaune) -> stercobilinogene (ocre) -> stercobiline (brun)

Brune : normal (stercobiline). Ocre : transit colique trop rapide (pas le temps de transformer la stercobilinogene). Jaune : transit intestinal trop rapide ou anomalie de la flore (bilirubine non transformée) : Verte (biliverdine, souvent chez les enfants ou trop de légumes verts ou médicament ou fer). Mastic : leucostercobiline du a une putréfaction exagérée ou une absence de pigment biliaire. Rouge : saignement bas ou aliments riches en carotène. Noir : saignement haut, boudin noir, charbon de bois, fer, bismuth. Blanche : ingestion de médicament à base de carbonate de chaux, kaolin, bismuth, sel de titane, baryte.

- Consistance : Ferme : normale. Moulée pâteuse : normale ou dysbiose intestinale. Dure et dure et fragmentée : transit ralenti, conso d’eau insuffisante. Liquide : transit digestif accéléré (pas le temps de réabsorber l’eau ) ou au contraire ralenti crée une hypersécrétion des glandes mucipares. Liquide avec fragment solide : idem, les sels durcie sont irrégulièrement délayées par le mucus. En bouse : transit accéléré. Granuleuse : excès de féculent non digéré. Spongieuse : selle de fermentation évacuation trop rapide du grêle, taux élevé d’acide organique, d’amidon de cellulose.

Pate a modelé : excès de gluten ou gluten non digéré

- Eléments surajoutés :

Glaire : Mucus dispersé dans la masse fécale : irritation haute : Mucus extérieur à la masse fécale : irritation basse

Sang : rouge dans la masse fécale : hémorragie basse ou haute avec accélération du transit. Extérieur de la masse fécale : lésion anale ou rupture d’hémorroïde

- Résidus alimentaires

Présence de résidu d’origine animale ou végétale : défaut de mastication, accélération du transit, déficience de la digestion

Observation microscopique

- Mucus : correspond à une irritation de la muqueuse

- Sang : Leucocytes : inflammation ou ulcération. Si hématies non altérées : saignement bas ou haut et transit accéléré

- Cellules intestinales : abondance signifie un renouvellement accélérée due à une irritation, une inflammation ou une prolifération excessive

- Résidus alimentaires :

Protides (fibres musculaires, traduit un défaut de mastication, une accélération de transit ou une déficience de la digestion.)

Glucides (conso excessive de glucides, mastication insuffisante, déficience de l’activité pancréatique exocrine, anomalie de la composition de la flore intestinale).

Lipides (lipide abondant stéatorrhée : graisse neutre : insuffisance pancreato-biliaire. acides gras et savon prédomine en cas de malabsorption (leaky gut, allergie, dysbiose),

Oxalate de calcium (conso excessif d’acide oxalique, risque de formation de calcul rénaux),

- Cristaux endogènes (cristaux Charcot-leyden témoignerait d’un état allergique)

- Flore iodophile flore de fermentation, elle signifie une prolifération anormale de la flore de fermentation dans le colon droit ou une accélération du transit colique

Analyse chimique :

pH	6,5-7,5 normal

< 6,5 : production excessive d’acides organiques par la flore de fermentation, production d’ammoniaque et d’amines par la flore de putréfaction, insuffisance des secrétions intestinales alcalines

> 7,5 : production insuffisante d’acides organiques par la flore de fermentation, production excessive d’ammonium et d’amine de la flore de putréfaction, excès de secretion intestinale alcalines

Acides organiques : < 13 insuffisant, déficit de la flore de fermentation

>17 excès de flore de fermentation

Ammoniaque < 2 déficit de putréfaction >4 excès

Analyse de la digestion :

Dosage de la chymotrypsine pancréatique : marqueur de l’activité pancréatique

Dosage de l’élastase pancréatique : marqueur de l’activité pancréatique

Dosage du valérate et de l’iso-butyrate : marquer de la digestion protéique par les bactéries du colon

Dosage des triglycérides :marqueur de l’activité pancréatique lipolytique

Dosage des acides gras à chaine courte globaux : produit de la digestion des hydrates de carbone par la flore de fermentation

Résumé : Marqueurs pour les 3 classes de Nutriments :

Protéine : Fibre musculaire, Activité de la chymotrypsine, Valeate et iso butyrate

Lipide : Triglycéride

Glucide : Fibres végétales, Acides gras à courtes chaines globaux

Analyse de l’absorption :

Dosage des acides gras à longue chaine, du cholestérol, des graisses totales : leur élévation traduit d’une malabsorption

Analyse des marqueurs métaboliques :

Dosage du butyrate : activité de la microflore de fermentation (mais il peut aussi être produit par la flore de putréfaction)

Dosage de la β-glucoronidase : microflore de putréfaction

Analyse des marqueurs de l’inflammation :

Présence d’histamine. Il faut exclure sa provenance d’aliments riches en histamine

Dosage de la lactoferrine : inflammation permet de détecter les maladies colorectales

Dosage de l’α-1 antitrypsine : inflammation permet de détecter les maladie colorectale

Dosage de la eosinophil protein X : permet de détecter les maladie colorectale

Calprotectine : permet de discriminer un intestin irritable, d’une maladie de crohn

Dosage de la polymorphonuclear elastase : permet de détecter des maladies intestinales inflammatoires

Dosage des IgA sécrétoire fécale : taux excessif révèle une inflammation de la muqueuse. Peu de sIgA peut signifier la souffrance des entérocyte

Dosage des IgA A anti-gliadine fécales : chez les coeliaques non traités

Dosage des acides et sels biliaires : une insuffisance peut expliquer une stéatorrhée

Les sels biliaires secondaire sont un facteur de risque du cancer colorectal

Test de l’haleine :

- Intolérance au lactose ou au fructose peut être détecté par leur administration et la mesure d’hydrogène dans l’air expirer. Si ils ne sont pas digérés, ils vont être métabolisés par la flore colique qui va produire de l’hydrogène et du méthane

L’intolérance au fructose est du a une faible quantité du transporteur GLUT5 dans la bordure en brosse

- Présence d’hélicobacter pylori peut également être détecté par ingestion d’urée marqué

Microbiologie : difficile de les cultiver en labo pour faire leur identification, car la plupart sont anaérobies et ne survivent pas dans les conditions du labo

Anaérobie : lactobacillus et bifidobacterium

Escherichia coli (version non pathogène) peut être utilisé comme marqueur d’une flore en équilibre

Bacteroides : excessif de l’ordre de 1011 et 1012

Levure : difficile de les cultiver en labo

Paratositologie : la encore difficile à faire

Biologie moléculaire

Analyse de l’ARNribosomal des bacteries permet de détecter les principales bacteries intestinales. Par contre , il reste de nombreuses bacteries non identifiées …

Chap 20 : Diagnostics urinaires

Test de la perméabilité intestinale :

Lactulose ou lactitol : 2 sucres disaccharides trop gros pour passer à travers la jonction serrée, absence de transporteur spécifique dans la bordure en brosse, une résistance aux enzymes

Le mannitol et le rhamnose: deux monosaccharides, petit taille lui permettant de traverser la bordure en brosse, présence d’un transporteur adapté, résistance aux enzymes.

On dose ces sucres dans les urines après ingestion d’une certaine quantité.

La détection de Lactilol dans les urines = passage entre les entérocytes

Mannitol réduite dans les urines = moins de passage par les entérocytes,

= Augmentation de la Permeabilité : le rapport lactulose / mannitol élevé

Présence d’Indolyl-acrylyl-glycine = métabolite du tryptophane produit par l’activité enzymatique des bacteries, de grande taille ne doit pas passer la barrière

Dosage des métabolites organiques urinaires

Révèle la présence de micro-organismes, ces métabolites sont réabsorbés et excrétés par voie urinaires

Marqueurs fongiques : D-arabinitol produite par le genre candida. Aussi l’arabinose, le tartarate et le beta-cétoglutarate

D’autres marqueurs fongiques : citramalate, 5-OH-méthyl-2-fuoate, furan-2-carboylate…

Marqueurs bactériens :

Clostridium métabolise les acides aminés aromatiques : phénylacétate, phénylpropionate, phenyllactate, phénol, OH-phénylacetate, OH-phenylpropionate, le para-cresol, indole, l’indoleacetate, indole-proprionate, indole-lactate

Chaque genre de clostridium a un métabolisme diffèrent

Indican est utiliser comme marqueur d’une putréfaction excessive

Chap 21 : Diagnostics sanguins

1) Biologie classique

- Inflammation digestive :

 Ferritine : - signe d’inflammation si les réserves de fer sont normales ou basse. Les

taux de saturation de la transferrine doivent rester sous les 50% sinon échappement du fer sous forme libre qui crée un stress oxydatif.

- Inflammation aspécifique

- souffrance hépatique

- hémochromatose

 Haptoglobine : - signe inflammatoire digestif haute

- signe inflammation aspécifique

 Hémoglobine : si poussée aigue de dysbiose

 Urée : dans les dysbiose

- Infection :

Protéine C-reactive : petite hausse . se modifie quand rééquilibrage de la flore

- Facteur de risque cardio-vasculaire

- polyarthrite rhumatoïde

Modification de la formule hémoleucocytaires

Hyperéosinophilie : atopie, parasitose, dysbiose à levure possible

Lymphocytose : infection virale ou fongique

Monocytose : mononucléose infectieuse ou dysbiose intestinale

IgA sérique globale : infection de muqueuse

Ige sérique globale : atopie, parasitose

Testostérone : signe d’infection

LH : assez spécifique de la dysbiose

T3 blocage de l’enzyme 5 déiodinase en cas de stress (de tout ordre)

- Activation des défenses immunitaires intestinales :

Myeloperoxydase : enzyme leucocytaire utile pour la défense antifongique

- Malabsorption des micronutriments :

Vitamine E : Moins absorbé souffrance non spécifique de la muqueuse

Vitamine A

Vitamine D

Vitamine K : dosée indirectement par le temps de prothrobine (reduit en cas de carence en vitamine K)

Vitamine B12 : absorption nécessité de l’intégrité du grêle

Zinc, cuivre : consommation par les microorganismes

Zinc et fer facteur de croissance des levures

Fer

β carotène : signe d’une parasitose, protozoaire, helminthe

- Immunité globale réduite :

Lymphocytes T4 et NK1 risque accru en cas de manque T4 chute sida, Nk1 stress

IgA : déficit prédispose aux infection

Antioxydant : déficit favorise les infection dosage des GPx gluthation peroxydase, et la SOD), les cofacteur selenium, cuivre, magnésium, zinc, vitamine antioxydant A, C , E, beta carotène), le coenzyme Q10 et le glutathion reduit

Fonction surrénalienne :avec la glande thyroïde, elle conditionne la qualité de la réponse immunitaire :

hormones surrénaliennes sériques : déhydroépiandrosterone, androstenedione, cortisol, testosterone (chez la femme),

salivaire : déhydroépiandrosterone, cortisol, testosterone (chez la femme), Hormones surrénaliens urinaires : 17-cétosteroides, 17-hydroxysteroides

- Tests à l’ACTH

- Ratio DHEA/cortisol

Fonctions thyroïdienne : relation hypothyroïdie et dysbiose

- Hormone thyroïdiennes T3 et T4 libre

- TSH élevée

- Auto-anticorps antithyroïdien

- Iode diminué

- Dysfonction enzymatique :

β carotène et vitamine A : la conversion se fait par l’enzyme β carotène 15-15’ dioxygenase. Cette enzyme est exprimée dans la muqueuse intestinale (action sous contrôle de la thyroxine).

Si pas assez de vitamine A : hypothyroidie ou dysbiose

2) IgE alimentaire

Lait animaux : Ig contre : caséine, α-lactalbumine, β-lactalbumine.

Le lait de chèvre et le lait de brebis peuvent générer des IgG surtout si il y a une réponse à la caséine. Fromage a pate dur : Ok si absence de réponse a la caséine

Céréales : Gliadine = froment, seigle, orge contiennent du gluten et également d’autres protéines (petit être positif même si gluten négatif)

Avoine contient du gluten mais généralement moins de réponse IgG que les autres

Riz, Mais, Millet : sans gluten mais peut être la cause d’allergie

Autres aliments allergisants: Poivre noir, betterave, ail, banane, bœuf, cacao, œuf, soja, the, café…

Valeurs IgG hautes généralisés : dysfonction de l’écosystème intestinale dysbiose, parasitose, maladie inflammatoire, réaction immunitaire à certains aliments (gliadine, lait de vache), leaky gut …

3) Maladie de coeliaque :

IgG et IgA contre la gliadine élevé

IgG et IgA contre l’endomysium

Biopsie

Développement de test anti transglutaminase

Chap 22 : Maitriser la dysbiose

Médicaments :

- Antimycosique (fluconazole, itraconazole, miconazole, ketoconazole, nystatine) attention à l’inhibition du cytP450 3A4 par les azoles, effets secondaires et problèmes de résistances.

- Antiprotozoaires : metronidazole (bien aussi contre les bacteries de putréfaction), tinidazole.

- Anthelmininthique : niclosamide,Mébendazole

Antimicrobiens naturels :

- Antimycosique : Extraits de pépin de pamplemousse : spectre large

Lactoferrine :protéine du petit lait libère au cours de la digestion un peptide antifongique lactoferrine B et lactoferrine H. Confère au colostrum son pouvoir immun protecteur, Acide undécyclénique : extrait de l’huile de ricin, Acide caprylique : extrait de la noix de coco, Origan : HE, présence de carvacrol et thymol, Thym, Sceau d’or (contient de la berberine, alcoloide quaternaire), Peu d’arco (écorce d’arbre de la foret tropicale), Arbre à thé (HE extrait d’une plante australienne), Noyer noir Aloes (contient dd’Arcoémannane, polysaccharide immunostimulant)

- Antiprotozoaires et anthelminthiques :

Ail, absinthe douce, potiron, girofle. Effet secondaires, toxicité et interaction moindre par rapport au médicament. On peut les associer et les alterner

Mesures nutritionnelles :

- Eviter les sucres rapides

- Eviter l’excès de glucides : pas plus de 40% (30% lipides, 30%proteines)

- Eviter le manque de lipides : régimes riches en lipides diminue l’immunité

- Nourrir l’écosystème :

- Exclure les aliments allergisants :à IgE et IgG

Céréales interdit pour les coeliaques : Blé, froment, Orge, Seigle,Tricale, Epeautre, Kamut

Céréales ne contenant pas de gliadine, hordéine et de sécaline : Avoine, Riz, Mil, Mais, Millet, Sorgho

Féculents non céréaliers : pomme de terre, Patate douce, Haricot, Soja, Sarrasin, Quinoa, Amarante, Manioc

Agresseurs à éviter :

Médicaments : antibiotiques, inhibiteur de la pompe a proton, anti-inflammatoire non stéroïdiens (hausse de la permeabilité), corticoïdes, pilule contraceptive (diminution du zinc, diminue la fonction surrénalienne)

Alcool : Altère les filament d’actine des entérocytes -> leaky gut

Généralement alcoolisme lié à la malnutrition qui affecte la flore

L’alcool inhibe l’absorption des vitamines et des nutriments, amplifie les déficit de vitamine B

Stress : assèche les secretion digestives ( salive, suc gastrique, suc pancréatique)

Diminue les défenses immunitaires, en consommant le zinc, chute des NK1 et en bloquant la transfo des T4 en T3

Epices fortes : agresse la muqueuse. Fréquent de rencontrer des IgG au poivre et l’ail

Chap 23 : Impact des antibiotiques

Pour éviter les résistance : éviter les antibiotiques à spectre large

Antibiotique décroit le niveau de la flore indigène et prédispose à la prolifération de levure

Dysimmunité :Des traitements antibio répétés pourraient réduire le degré d’immunité par une diminution de la stimulation suscitée par les bacteries commensales. Diminuer les bactérie importante pour stimuler les th1,

Chap 24 : Optimiser la microflore

1) Probiotique

Bacteries appartenant à la flore de fermentation : Lactobacillus (rhamnosus, acidophilus), Bifidobacterium (bifidum)

On trouve aussi Enterococcus faecium, mais réserve car le genre enterococcus responsable de maladie nosocomiale

Saccharomyces boulardii levure fréquemment utilisé

Probiotiques et immunité :

- Induction de production d’IgA : Lactobacillus, bifidobacterium

- Liberation de peptides immunostimulants : Lactobacillus, propionibacterium

- Production de cytokines modulant la réponse Th1/Th2 : Lactobacillus

- Inhibition d’autres espèces bactériennes : Bifidobacterium longum diminue les Clostridium et Bacteroides. Bifidobacterium inhibe Salmonella typhimurium

- Immunostimulation su système humoral : Lactobacillus acidophilus, Lactobacillus bulgaricus, bifidobacterium bifidum

- Induction d’un développement correct du système immunitaire : Effet des probiotique sur le Galt

Probiotiques et infections gastro-intestinales

- Infection par Helicobacter pylori : L’addition de lactobacillus et des bifidobacterium permet l’amélioration avec l’addition d’antibiothérapie

- Infection par une souche pathogène de Escherichia coli : prévention par bifidobacterium, protection de la bordure en brosse par lactobacillus acidophilus

Streptococcus thermophilus et lactobacillus acidophilus protège contre les effets délétères

Infection par Clostridium difficile : Lactobacillus rhamnosus GG, Lactobacillus plantadaire et saccharomyces boulardii favorable sur les diarrhée à clostridium difficile

Seulement 10 à 20 % des cas de diarrhée post antibiotique sont causés par clostridium difficile. Clostridium perfringens, Staphylococcus aureus, Klebsiella oxytoca, salmonella, candida. Lactobacillus acidophilus, Lactobacillus bulgaricus, bifidobacterium longum, enterococcus faecium, saccharomyces boularii marchent bien contre les diarrhée postantibiotique

Probiotiques et inflammation intestinale :

- Inflammation de la muqueuse intestinale :

Bifidobacterium bifidum et lactobacillus acidophilus reduit l’inflammation du colon

- Syndrome du colon irritable : Lactobacillus plantarum diminue douleur et flatulence

- Maladies intestinales inflammatoires : favorable explication diminue l’inflammation et diminue les bactérie de putréfaction

Maladie de Crohn : Lactobacillus rhamnosus module les cytokines pro-inflammatoire

Recto-colite ulcéro-hémorragique :

- Pouchite : complication post-opératoire peut être prévenu par des probiotiques

- Entérocolite necrodante des prématurés

- Cancer colorectal

Probiotiques et maladies allergiques

Prévention et guérison

Lactobacillus et Bifidobacterium activent les lymphocytes Th1 suffisant pour corriger l’excès de Th2

Bifidobacterium lactis et Lactobacillus rhamnosus GG chez le nourrissons souffrant d’eczéma atopique Amélioration après 2 mois. On cite aussi Lactobacillus reuteri

Probiotiques et allergies alimentaires :

Microflore réponse inflammatoire vis a vis des pathogènes et faible réponse vis a vis des antigènes inoffensifs

Réduction des troubles liés a l’intolérance au lactose car bactérie produit du lactose

Probiotiques et pathologies diverses :

- Constipation : Lactobacillus rhamnosus et propionibacterium freudenreichii

- Gastroentérite sporadique des voyageurs : probiotique en prévention

- Infections urogénitales Lactobacillus

- Accouchement prématuré

- Carie dentaire (causé par une bactérie steptocossus mutans)

- Infections nasales

- Pancréatite aigue

- Mucoviscidose

- Traumatismes cérébraux

- Syndrome de fatigue chronique

. Dyspepsie non ulcéreuse

Considérations générales sur les probiotiques :

Fiabilité des étiquetages : 47 % des probiotiques seraient mal étiquetés et contiendraient des souches non déclarées.

Viabilité : association avec des prebiotiques augmente la viabilité

Prise : A prendre plutôt le soir, car pas de repas après et faible acidité gastrique

2) Prebiotique :

Nourri la flore de manière sélective. En particulier, lactobacilles et bifidobacterie

Avec des fructane (FOS) et en galacto-oligosaccharides (GOS) stimule la croissance des bifidobacteries (effet bifidogène)

- Fructo-saccharide = polymère de D-fructose, fibres solubles non digestibles par nos enzymes mais par les enzymes bactériennes = β-fructosidase secrété par Bifidobacterium.

On trouve l’oligofructose et l’inuline dans les légumes et certaines céréales. (Artichaut, topinambour, chicorée)

Bénéfique pour : Maladies inflammatoires intestinales, infections intestinales (en cas de clostridium difficile), constipation et cancer colorectal, assimilation du magnésium, du calcium, homéostasie des lipides (réduit les triglycérides sérique et hépatiques), encéphalopathie hépatique

Prebiotique peuvent produire du gaz chez les sujets qui consomment bcp de fibres. Eviter de donner si bcp ballonnement

Pas de bénéfice a la prise de prebotique si déjà une grande consommation de fibres végétales et hydrate de carbone.

- Peptides bifidogenes :

Promoteur de la croissance des bifidobacteries : α-lactalbumine et de lactoferrine

Leur digestion libère des peptides actifs

Lactoferrine : digestion -> 3 peptides, 2 sont bifidogenes et un peptide qui stimule la croissances des entérocytes

- Galacto-oligosaccharides : polymère de galactose digéré par la β galactosidase des bactéries notamment Lactobacillus et bifidobacterium. GOS sont formés à partir du lactose ?

Bénéfique pour :Constipation, cancer colorectal, assimilation du calcium

3)Symbiotiques : observe des effets synergiques. Hausse des IgA sécrétoire

Chap 25 : Soutenir la digestion

Acide chloridryque : symptômes : hypochloridrie : sensation d’être plein même après un repas non copieux, douleur abdominale post prandiale. On peut observer une digestion lente, une halitose (haleine fétide), des éructations, ballonnements, flatulence, pyrosis, nausée, vomissements, diarrhée, observation de résidu alimentaire dans les selles

Cause : carence en zinc car cofacteur de la production d’acide chlorhydrique par l’anhydrase carbonique, lien avec l’hypothyroidie et l’insuffisance surrénalienne, Helico bacter pylori

Traitement : on peut administrer de l’acide chlorhydrique dilué,

Hypochloridrie peut être décelé si il y a une amélioration des symptômes par la prise de vinaigre de cidre a jeun

Enzymes digestives :

Augmenter : Mastication suffisante, pas d’excès alimentaire.

Prendre des enzymes digestives en cas de Leaky gut pour éviter de stimuler inutilement le système immunitaire par des aliments incomplètement digérés

Il existe des mélanges d’enzyme pancréatique provenant d’animaux ou de végétaux (supporte mieux le passage dans l’estomac)

Lactase, Saccharase, Alpha galactosidase (pour lutter contre l’excès de gaz)

Ces enzymes seraient efficaces pour la prévention des allergies

Polyl-endopeptidase serait capable de dégrader le peptide issu de la dégradation de la gliadine

Bile : Incapacité de digérer les lipides, nausée, vomissement, dyspepsie, pesanteur postprandiale

La cause peut être un déséquilibre de la flore avec fermentation excessive

On peut à ce moment la rééquilibrer la flore

Des extraits de bile existent aussi

Herbes digestives :

Stimulent secrétions digestives : cumin, gingembre, HE carvi, menthe poivrée

Améliore digestion : fenouil, aneth, cèleri, anis vert

Substrat bacteriens

Renforce flore de putréfaction par protéines du petit lait

Chap 26 : Abaisser la perméabilité

Glutamine de 4 à8 gr

Zinc : cofacteur de nombreuses enzymes et stimule l’immunité

Sels organiques (orotate, gluconate) ou chélates (picolinate, oxoproline) association zinc – a a, absorption comme un acides aminée > 45g

Rétinol : immunité innée et acquise, renouvellement de l’épithélium

Vision crépusculaire (le 11cisretinal groupement prosthétique sensible aux photons d’un GPCR membranaire = la rhodopsine

Toxique peut s’accumuler dans le foie, pas chez la femme enceinte.

10000UI pas plus de 20000 pdt 3 mois.

Contenu dans huile de foie de morue ou flétan

Acide folique : abso dans le jéjunum transformé par la ptéroylpolyglutamate hydrolase pour être absorbé. Cette enz peut être perturbée dans la maladie de coeliaque ou lors de la prise de certains médicaments

0,4mg en préventif ->4mg en curatif

Butyrate :

Energie des colonocytes, lutte contre le leaky gut, synthèse d’enzyme stimulant le développement des muqueuses, action anti-inflammatoire, induit l’apoptose des cellules cancéreuses, différentiation cellulaires des colonocytes

Rarement administrer, apport alimentaire

N-acetyl-glucosamine , avec le galactose, il est constituant des chaines oligo saccharides des glycoprotéines du mucus intestinal

1-2g

Phospholipides : lécithine de soja bonne source

Omega 3 : membrane cellulaire, souplesse, améliore les transports de la muqueuse, pourrait moduler l’action des probiotiques en stimulant leur adhésion a la membrane

Huile de poisson gras, huile de graine de lin, noix, colza

Antioxydant : protection des membranes

Sélénium, quercetine (fonctionnement des muqueuses et stabilisation des mastocytes, régule des enzymes de detox UDP-glucuronyl transférase 1 de la muqueuse, réduit la perméabilité des capillaires = propriété anti-diarrhéique)

Crohn : la supplémentation de vitamine E et C diminue le stress oxydatif

Plantes : ginkgo protège la muqueuse des dégâts de l’ischémie

Aloes : stabilise les mastocytes protégeant des agressions, stimule la secretion

Thé vert : protège les entérocytes contre l’apoptose induite par des oxydants, protège l’atrophie de la muqueuse

Réglisse : protège la muqueuse contre les empoissonnements par des métaux lourds

Multivitaminés : complet les déficits par complexe : ne pas prendre de fer ni de cuivre

Vers trichocéphales induit une réponse Th2, ce qui diminue les réponses Th1

On administre 2500 œufs.